Mucindegradatie
De slijmvliezen van de darmen beschermen tegen infecties en ontstekingen. In het darmbioom spelen mucinevormende en -afbrekende bacteriën daarom een belangrijke rol. Soorten als Akkermansia muciniphila en Prevotella sp. breken het darmslijmvlies af, waardoor dit zich kan vernieuwen. Soorten als Faecalibacterium prausnitzi profiteren van de afbraakproducten van het darmslijm en hebben een beschermende werking tegen darmontstekingen.